Каждый организовывает дисковое пространство так, как ему удобно. Рекомендовать 1, 2, 100 разделов - пустая трата времени. Для себя сделал так:
1. отдельный HDD под систему и софт
2. HDD с тремя разделами
- раздел под загрузки, тестируемые программы, каждый день что-то записывается/удаляется (фрагментация большая)
- раздел под хранение (фрагментация почти отсутствует)
- раздел под резервную копию ОС (фрагментация почти отсутствует)