В питание никогда на постоянку не поставят фильтр без полярности - он и ставится, чтобы сгладить колебания - и +. Как я понял - питание двухполярное, значит у конденсаторов есть общая точка. Конденсатор, который нагревается, поставь так же, как стоит тот, что не греется, то есть маркировкой расположи так же - полярность станет, как должна быть. Если продолжит греться - под замену. Но для начала какой нибудь простой дешевый для проверки. Если и замененный будет нагреваться - ищи проблему в разводке.