Я бы не торопился с выводами. В какие гнёзда всё включено? Во многих, в том числе и относительно дорогих корпусах, слабоваты провода USB на дополнительные панели. Если проблема идёт при работе с портами, распаянными непосредственно на задней панели материнки, то пробуйте переустановить драйвера чипсета, возможно даже не самые последние, запретить в настройках "отключение портов с целью экономии энергии", вообще поиграть с планами энергосбережения на уровне системы и биос.