Насчет Фикс - то отскриненное окошко появилось после запуска autorun'а программы. Было первоначальное окно с выбором "Run Utility или Exit", жму Run и появляется "re-registered all". Вашего окна с вариантами фиксов не было, я дважды скачивала и проверяла архивы из разных источников.
По командной строке отпишусь позже.