Вообще-то непонятно, с чего он у тебя сразу так засорился? Там, конечно, все темпы и файл подкачки (который ты можешь, кстати, и на Д поставить), ну и рабочий стол - если на него чего валишь, это все там.
Я всегда именно так и делаю - после установки виндов если новые программы и данные располагать на других дисках, то занятое пространство на С растет ну максимум раза в полтора.