Модные фирменные радиаторы покрывают порошковой краской на основе полиэфирных или эпоксиполиэфирных смол. Краска выдерживает до 150 град.С. С точки зрения теплообмена, любое покрытие радиатора ухудшает теплоперенос. Но красота требует жертв. При слое краски в 100мкм ухудшение теплопереноса незначительное (гравное чтобы не было наплывов краски в месте контакта радиатора с микросхемой).
Вероятно, снижение температуры видеокарты обусловлено заменой термопасты, нежели удалением красочного слоя.