Шина сата идет не отдельно, а по шине IDE, отсюда могут быть конфликты...
Винт или сам должен работать на 1/2 скорости, либо перемычкой принудительно.
Иногда проблем нет, но зачастую 2 разных винта не уживаются на "переходных" мамках. Сата-винт в одиночку должен работать без проблем. Пробуйте комбинировать. Например основной винт кинуть на IDE2 secondary. Так-же надо пробывать варианты в биосе.