1. воспользуйтесь другим дистрибутивом системы.
2. в БИОС надо переключать режимы первого запуска на привод, иначе система будет грузиться опять с харда.
3. коннекторы действительно не стОит отключать часто, но зато есть выход: отключать в БИОС нужный Вам хард
4. что касаемо пиратской версии винды все правы: ведь большинство косяков из-за этого, а значит возвращаемся к п.1.
5. остальные вопросы "по ходу пьесы".