Может с приоритетом загрузки напутал, первым устройством должен стоять дистрибутив, вторым жесткий диск. Перед установкой нужно снести разделы и устанавливать на размеченную область. В случае необходимости акронисом можно все восстановить. Резервная копия должна содержать все разделы, включая скрытый.