Устанавливать лучше было с форматированием диска С в формате NTFS. А так искать ненужные папки довольно муторно. Но могу посоветовать следующее:
нажмите Win+R
введите %systemroot%
посмотрите, в какую папку вы попадете (Windows или Windows.0)
удалите ненужную папку, то есть ту, в которую вы не попали (если попали в виндоус.0, то удаляйте папку виндоус, и наоборот)
удачи