А какая разница ? И на фабричном шунте, и на низкоомном резисторе будет падать одинаково маленькое напряжение. И если его не усиливать, то ток будет меряться с точностью +/- лапоть.
Или вы про 0,1 ома ? Так уже выяснили, что падение напряжения на нем достаточно велико.
Если б делал я (и задешево), то взял бы штук 5-10 резисторов по 0,1 ома и включил их впараллель.
Далее,
rail-to-rail ОУ стоит аж целых 62 руб.
Коэффициент усиления задал бы ему в 10-20-50.
В итоге поимел бы гораздо более вменяемые и падение напряжения при максимальном токе, и напряжение на входе АЦП.