Попробуйте засечь из-за какого именно процесса подвисает комп. Лучше, если не родным диспетчером, а например process explorer'ом. И какой процесс грузит систему после включения, когда он долго думает.
В Шопе еще советую посмотреть какие установки на стречдиск - где он хранит темпы во время работы, может ему места элементарно не хватает.