Для передачи данных обратно они совместимы, верно.
Вот только максимальный ток у них разный (0,5А для USB 2 и
0,9А для USB 3.0 для одного порта). Для жесткого диска с контроллером не всегда достаточно 0,5А для нормального запуска, поэтому и применяют кабели с "аппендиксом" для дополнительного питания от второго порта.