На это могут влиять многие факторы, начиная от биологических (недосыпание, не хватка определенных витаминов и т.п.) так и физических (например не правильная настройка оборудования или его частичный выход из строя).
Например при не правильном разрешении, частоте кадров и прочего может значительно возрасти нагрузка на глаза. Так же на это влияет постановка освещения в комнате (свет от окна должен светить слева, но не в коем случае не прямо из за монитора).
К примеру у меня был монитор Samsung ЖК я его поменял на монитор ASUS и практически сразу появились ваши симптомы. Все меня раздражало начиная от яркости и заканчивая цветопередачей и когда мне предложили поменяться на монитор Acer я не раздумывая поменялся - симптомы пропали, картинка устраивает.
В общем надо найти источник раздражения...