Так ты клонировал Windows 10, а не весь диск. У тебя он и остался на hdd. Вот как записать флешку я сам никогда не делал и не знаю. Попробуй посторонней программой типа акронис назначить букву на диске 2 разделу восстановления. И перенести его на SSD.