Я могу только предположить, что во время перезагрузки возрастает энергопотребление всех узлов, соответственно напряжение питания проседает, а таблица разделов слетает, т.к. к ней в первую очередь происходит обращение.
Надо осмотреть БП и док-станцию на предмет вздувшихся электролитов.