Что держать на флэшке, это дело каждого, кому как удобно. У меня имеется загрузочный CD-диск Acronis Boot CD и внешний USB HDD большого объёма, для хранения образов разделов жесткого диска. Этого достаточно для восстановления.
Ещё на загрузочной флэшке имеется Microsoft Diagnostic and Recovery Toolset (MSDaRT) All in one, на всякий случай.
