Если у видеокарты закрытая система охлаждения, то горячий воздух она выбрасывает сзади, там где разъёмы, а её собственный вентилятор, в этом случае, должен втягивать холодный воздух. Этот холодный воздух и должен нагнетать извне боковой вентилятор, т.е. боковой вентилятор должен работать на вдув.