Тут есть несколько путей.
1. Попробовать
создать новый профиль и поработать с ним. Закладки можно легко импортировать из старого профиля.
2. Сохранив файл закладок или весь старый профиль, снести FireFox, удалить все компоненты и поставить браузер заново.
Есть еще варианты типа загрузки в безопасном режиме и т.п.
А вообще, не зная некоторых моментов, очень трудно сориентироваться в Вашей проблеме. А именно: какая ОС? какая версия FF? какие расширения установлены? установлены или нет, а если да, то какие сторонние тулбары? Последнее особенно важно, потому что эти тулбары (MEGAUPLOAD, Yandex, даже Webmoney Advisor, не говоря уже про такую хрень, как AdCentriaIM) часто и являются источниками конфликтов.