Метр, если не самого дешевого китайского кабеля, то это отлично.
Вопрос у вас довольно сложный. Он может быть связан как с проблемами декодирования контента, содержащегося в mkv (не стоит забывать, что mkv это мультимедийный контейнер), так и с некорректной работой видеокарты ноутбука и проектора по HDMI.
В первом случае советую посмотреть на какие именно кодеки используются в "тормозящих" файлах, 1080p или 1080i используется.
Во втором случае советую подключить вместо данного ноутбука какое либо другое устройство для проигрывания и посмотреть будут ли тормозить те же файлы с другим проигрывателем.