Насколько я понял скоростью BLDC заведует частота тока, а не напряжение.

В любом случае, управление будет представлять собой микроконтроллер, подключенный к одному из интерфейсов (USB, RS232, LPT).
http://www.tehnari.ru/album.php?albumid=157

Запутался я. В общем, у меня есть движок от харда(3 обмотки с центральным проводом). Мне надо чтобы он крутился (почти без нагрузки) с заданными оборотами 500-5000 (примерно). Я перечитал много интернета и понял что это ни разу не просто для нерадиолюбителя.

Это реализация метода spin-coating - нанесение тонких пленок. Мотор будет крутить небольшие стеклянные подложки размером 50х15х3. В данном случае скорость вращения определяет толщину получаемой пленки, поэтому обороты необходимо задавать точно и поддерживать в течении некого периода времени.

если можно, объясните на пальцах, как это сделать?

Потребуется микроконтроллер, микросхема TDA, устройство индикации. В ПК необходимости нет.Микросхема имеет вывод, информирующий о частоте вращения двигателя.Контроллер будет задавать нужную частоту и корректировать ее, по необходимости.Все это реализуемо.

Ну, купить все что надо - не проблема.
Что куда паять - вот в чем вопрос=)

Есть два варианта - ручная регулировка частоты вращения с контролем по тахометру, и автоматическое регулирование.

В принципе, оба варианта приемлимы, автоматический, конечно лучше, но и ручной тоже пойдет. Разница в сложности исполнения разительна?

Нет. Проблема в том, что на ручной есть схемы всех трех блоков - регулятора, драйвера и тахометра, а также прошивка для контроллера.
На автоматический нет ничего, разработка займет от недели до трех.

в таком случае, конечно, лучше ручной

Регулятор
http://www.tehnari.ru/f119/t38160/#post364610

Тахометр
Вложение 17310
Его схему и прошивку придется адаптировать.

Ну и схема драйвера из первого поста.