Знаю 2 проги. Это Камтазия (Camtasia Studio) - она используется не только для создания субтитров. Это больше видео-редактор.
2 прога - Subtitle Workshop. Программа проще гораздо, нежели первая. И позволяет создавать как внешние, так и вшитые субтитры. Хотя для создания вшитых необходим плагин.