Посмотри VirtualBox настройки USB. Скриншот я выложил выше. Там есть значок USB с плюсом. Выбери клаву и мышь, с которой будет работать виртуальная ось. Я так подключал внешний HDD. При подключении диска к виртуальной системе, в основной системе его не было видно. Т.е. думаю, что влиять вторая клава не будет. Пробуй.