Если на материнке есть разъем SATA а он на 99,99999999% там есть, то проще и дешевле купить обычный внутренний HDD а потом просто перенесете его в новый системник (он заработает там без проблем).
Но если переносной и впрямь нужен, то выбор за вами.
У вас могут появиться проблемы если вы будете извлекать диск в момент работы торрентов а также при повторном подключении если в комп будет подключена флешка. Диску присвоется другая буква а торрент клиент начнет качать файл по новой на флешку которая получила букву диска на который изначально происходило скачивание.