Версия Debian, какое ядро, включен ли был selinux и названия вирусняков? Торчал ли юзер под рутом?
Интересно просто. У меня три машины дома 9-й год под линуксом и без гадостей. На работе сервер с аптаймом в несколько лет - тоже. Сервак как раз под дебианом