В итоге должен получиться оптический диск внешне всего с двумя файлами: прошивка и прошивальщик, загрузочных файлов из-под Windows не видно. При загрузке с него эмулируется и выглядит как загрузка с дискеты, выбираешь загрузку с поддержкой CD-ROM, переходишь на CD и запускаешь прошивальщик.