Может слишком много винтов SATA большой емкости? Данные можно бросать и на выносной бокс-носитель USB. Как вариант, было такое на работе - контроллер SATA барахлил, то видит диск то нет. Поставил 80 Гиг. (а больше и не нужно было) для регистратора переговоров. Год уже работает.