Можно намотать и на одной катушке 12В, но не желательно, лучше намотать на двух по 6В. Иначе, при серьезной нагрузке на 12В, возникнет перекос по напряжению на обмотках по 20В.
Ленту фум лучше в качестве изоляции не использовать. Фторопласт имеет холодную текучесть (особенно в этой ленте) и со временем провод его продавливает.
Склеивать половинки можно. Толщина зазора в несколько сотых миллиметра какого-либо значимого влияния на параметры трансформатора не оказывает. Теоретики могут взять формулы, просчитать и убедиться сами. Тем более, что если взять клей с хорошей текучестью, то зазора как такового и не будет, клей заполнит только неровности плоскостей.