Винчестер разбивается по цилиндрам: "0" сторона, "0" дорожка 1 пластины; "1" сторона, "0" дорожка 1 пластины; "0" сторона, "0" дорожка 2 пластины; "1" сторона, "0" дорожка 2 пластины и так далее... Исходя из размера логического диска система устанавливает размер кластера на диске. На сегодняшний день лично я беру размер системного диска 60 гигабайт, если у тебя стоит пятисотник, то, учитывая переменное число секторов на дорожке, 60 гигов займут на радиусе процентов пять, и второй раздел диска вполне будет отвечать твоим запросам.