Алгоритм очень прост: загрузочный раздел должен быть создан на устройстве, с которого была произведена загрузка, если на этом устройстве разрешена запись. Загрузочную флешку в таком случае надо форматировать как USB CD-ROM, использовать флешку с защитой от записи или использовать дополнительные ключи при установке системы, позволяющие выбрать раздел для установки. Иногда я использую фокус с разделом FAT32, который делается DOSовским загрузочным, а в процессе установки конвертируется. С семёркой просто я слишком мало ещё работал на экзотических конфигурациях, поэтому опыта не хватает для более точных ответов, только направления поиска.