1)Лучший вариант - поставьте Debian (тем более если вы знакомы с бунтой то переход будет безболезненным)
а) 99% что все у вас встанет из коробки без шаманств
б) Стабильность работы (что для сервера критично) у дебиана выше в разы.
2)Если вы все таки намерены поставить убунту. Я бы посоветовала
а) Ставить с alternate (именно с alternate ) в экспертном режиме (F6 вроде)
б) Стоит поиграть с опциями - пошаманить с mdadm. Так же попробуйте включить nodmaraid (потом при разметке выставите что то типа "Метка для RAID" ). В биосе раид лучше на время экспериментов выключить. Если не вышло, выполните пункт 1 (предварительно отписав здесь результаты)