Какая версия 1С? В 7-й версии запускаете 1С, жмете изменить, смотрите путь базы, соответственно копируете/переносите базу с указанной директории.
В 8-й версии также жмете изменить, далее появится имя базы, жмете далее, там появится путь(директория) и также по указанной директории находите и копируете базы.
Важно: все названия и пути баз сохраните в текстовом документе, потом после переинсталляции ОС перенесете базы в те же самые директории и пропишите к ним уже сохранненые в txt пути.