Не знаю, как в Ридере, а в Акробате на эту тему есть некая опция печати. Надо войти в печать, там перейти на вкладку "Advanced" на которой найти чекбокс "Print as Image" ("Печатать как картинку"), куда и поставить галку. Если в Ридере такое есть, это решит проблемы. Крякозябры же возникают потому, что Ридер пытается подставить свои шрифты, а если документ на кириллице, то и получается путаница с кодировкой.