Если еще углубиться в историю, то прародитель это куница, кунка у коренного населения Зауралья- Прибайкалья. Торгуя с прибывшими казаками, они нахваливали мех куницы, сравнивая его с (ну понятно с чем). Ну и прижилось слово от Волги-матушки до самых до окраин. Ну и зэки, естественно, подхватили- все ж остроги, да каторги там были.
Интересно, что в Новгородской, Псковской областях, кунка также означает кружку для вина. Так что, там мужики думают об одной кунке - но боольшой!