Или как вариант -- Virtual Dub. Я его обычно юзаю для таких целей. Клип удобнее делать в Movie Maker, а кусок вырезать -- в дубе. Только не забудь поставить во вкладке видео параметр Direct Stream Copy, а то размер тебя "приятно" удивит -- по гигу на каждые минут 5-10