Включите в свойствах папки отображение скрытых и системных файлов.
Посмотрите в какой из папок Windows лежыт файл boot.ini, откройте его блокнотом и посмотрите пути обращения к диску.
---
Если файл boot.ini лежит в папке Windows на диске D: а на C: его нет, то такое может случиться если диск C: не установлен активным.