PCI-E не совместим с PCI,разъемы разные.Чтобы видеокарты работали в паре нужна поддержка режимов SLI(nVIDIA) или CrossFire(ATI) на материнской плате,а это уже подразумевает наличие на ней двух и более разъемов PCI-E.Плюс еще небольшое отступление-для корректной работы в этих режимах
желательно наличие двух одинаковых видеокарт(не всегда,конечно,но все же.)В Вашем случае лучше заменить имеющуюся видеокарту на более мощную,например GF8600GT/GTS.Они недорогие.