Зависит от ситуации и цели.
1. Чай горячий. В этом случае его надо посахарить и мешать ложкой, после чего ложку оставить в чашке. При перемешивании чай остывает, так мало того, ложка работает как радиатор.
2. В чае варенье с ягодами. Вынимать ложку - лишить себя ягод.
3. Чай не горячий, ягод нет. Вынимаем ложку, ибо можно проткнуть глаз. Будет не до чая.
4. В доме мало ложек. В таком случае, в любую кружку надо класть ложку, иначе в нужный момент можно остаться без неё.
5. Кружка ваша а ложка нет. Тут главное не спалиться.
На первый взгляд всё.