Нужны рекомендации по выбору системных плат
 

Какие существую рекомендации по выбору системных плат для работы ПЭВМ для решения прикладных задач?

Никаких ;)
Для начала необходимо очертить круг задач и критерии работы системы.
Исходим из максимальной надёжности:
Путь первый - собрать систему из дорогостоящих высококачественных компонентов.
Путь второй - собрать систему из максимально усреднённых дешёвых запчастей, а в случае поломки быстро заменять модули на столь же дешёвые и доступные, не задумываясь над их ремонтом и причиной выхода из строя.