Пробовал и в ручную всё удалять, после перезагрузки всё возвращается. В автозагрузке ничего лишнего нет.

А может вирус зайти в биос?

Наконец-то вирусы удалось удалить, больше не появляются после перезагрузки!
Но комп по прежнему работает медленно, в чём же тогда причина?

Чем удалили всё-таки?Насчёт медленной работы компа:в диспетчер задач зайдите,гляньте,какой процесс грузит систему.Почистите реестр и систему от мусора,сделайте дефрагментацию.

Выложи скрин ДЗ и автозагрузки (пуск- выполнить- ввести "MSCONFIG"- ОК- вкладка "Автозагрузка").

Выложи скрин ДЗ, это что такое?

Диспетчер Задач. Только поставь галочку "Отображать процессы всех пользователей".

Там как не странно всё в норме, но процессор работает с тормозом.
Наверное что-то с железом, как протестировать железо?

"Злых" процессов вроде не видно, автозагрузка практически чистая. Советую ещё убрать "Nero Check", не думаю, что он нужен в автозагрузке.

Разве попробовать поработать без антивируса, убрав из автозагрузки и убив все его процессы. Далее копать в сторону температур и железа. Драйвера материнской платы также обновить не помешает.

Пробовал убирать "Nero Check" и антивирус, эффекта никакого.

Температура в норме, проверял эверестом HDD-45Гр. CPU от40 до 50Гр не более.

KUS, Почитай мою статью в этом посте, там про сигнал биоса, это после того случая стало так.
Что бы это могло означать? http://www.tehnari.ru/414317-post22.html