Перенос кода программы с ATmega8 на ATmega32
 

Ситуация такая: было устройство, которое работало на Atmega8, причем не только в Протеусе, но и в реале.

В связи с необходимостью расширения функционала данного устройства было решено перенести программу с соответствующей корректировкой исходного кода на контроллер Atmega32, у которого больше пинов. Только на этом новом контроллере программа после корректировки не заработала ни на симуляторе, ни в реале. Точнее - выходные сигналы перестали появляться на трех пинах в необходимой последовательности через необходимые интервалы времени. С фьюзом JTAG работал - бесполезно.

В чем может быть дело? Исходник и файл протеуса прилагаю

А не подскажете в какой программе собирать проект чтобы получить
файл прошивки.
Хотя я тупой могу и не собрать!

А у вас софт лицензионный? У меня был случай с проектом под Альтеру, компилил в нелицензионном Квартусе. В итоге проект на JTAG работал, после прошивки ППЗУ нифига вообще ничего не работало( Опытным путём обнаружил что если создавать загрузочный файл в автоматическом режиме-он получается кривой и не работает. В ручном режиме создал-всё заработало.
И даже если у вас софт лицензионный-там могут быть ограничения о которых производитель софта не всегда говорит. С Альтерой мне рассказывали-запускали их IP ядро, оно работало 40 минут и кранты)

А при чем здесь ПЛИС если я правильно понял исходник написан на языке СИ.
JTAG здесь фьюз, а не разъём.
У программ есть пробный бесплатный период или некоторые ограничения, а AvrStudio4 вообще бесплатна, а так же есть альтернатива и в Linux

Фьюзы можно прошить так, что потом микросхему менять придётся)
Язык не важен, важно внимательное отношение к проекту. Проверить всё ещё несколько раз.

Согласно схеме задействован порт С
биты 5 6 и 7 должны быть настроены на выход.
у вас настроен на выход почему то нулевой бит
PORTC=0x00;
DDRC=0x01;