дело не в материнках, а в дистрибутиве операционки. в 7 sp1 уже интегрированы драйверы, при установке проблем не возникает. если ставите операционку постарше, соответственно драйверы нужно ставить отдельно. выглядит примерно так:
sata mode:
ide > простая установка, драйверы sata/raid после установки ОС ставить не нужно!
(из минусов - меньшая скорость на ssd, нет горячего подключения "hot swap")
ahci/raid:
win 7 sp1 и выше - установка ос, установка драйверов sata/raid
win 7 - во время установки ОС ставим драйверы с диска с матплатой, после установки переставлять драйвер не обязательно.
win xp - во время установки ОС ставим драйвер с дискетки, предварительно его записав с диска. имеет смысл заниматься только для организации raid-массивов, от ahci никаких плюсов не будет под хр. после установки желательно поставить драйвер с утилитой мониторинга (intel rapid storage и аналоги)