Гигабайты бывают разные
1 Гб = 1024 Мб = 1048576 Кб = 1073741824 байт
А можно посчитать "в попугаях", то есть начать округлять до цифр, кратных 10 на любом этапе этого процесса. Виндовс считает обычно правильно, хотя тоже не всегда, а маркетологи фирм-производителей - так, как им удобнее, чаще всего по десятичным меркам, ведь так получается больше.
В вашей ситуации, скорее всего, получился ещё один, и довольно неприятный вариант: система просто потеряла пространство где-то в скрытых разделах. Восстановление - вещь нудная и довольно рискованная с точки зрения возможной потери данных на всём остальном пространстве. Я бы рекомендовал скопировать всё необходимое на внешний диск и просто переустановить систему с удалением в процессе переустановки всех имеющихся разделов и созданием новых.