Хмм... При быстром просмотре мне вот что в глаза бросилось из файла install.php:
echo "Creating ffdb_files table...<br>";
$mysql->Query("CREATE TABLE ffdb_files (
......
PRIMARY KEY (file_id,file_id))");
......
ИМХО, этот параметр должен быть PRIMARY KEY (file_id))");
А там стоит повтор, вот и ошибка. И проверьте весь этот файлик до конца на всякий случай.