Проверьте состояние ключа
BootExecute в реестре по статье
удалено... (выкладывайте информацию сюда)
Возможно вы комп некорректно выключаете или какое-то приложние при выключении/перезагрузке аварийно падает и не успевает завершить операцию записи на диск.