Подозреваю, что при сборке собрал чего-то не совсем правильно и система перегревается. Проверь, например Everest'ом. Как вариант может быть слабый/подубитый БП для данного ПК. Укажи, какие комплектующие, что на что менял, новое/нет и тд. То что тише стало работать, дык может кулл просто какой не подключил?