Нет, с правкой прошивки ничего путного не получилось, слишком запутанная, исходник из восьми файлов. Мозги можно поломать, не зная замысла автора.
Но, в поисках решения зашел на сайт-первоисточник схемы и нашел нечто более интересное. Как оказалось, у автора есть практически такая же схема и прошивка с регулированием скорости переключения светодиодов. Скорость устанавливается подстроечным резистором PR1 и подбором конденсатора C4. Это ссылка на страницу со схемой и описанием на английском
PWM LED chaser with variable speed control.
Ниже схема и прошивка в архиве. Прошивку проверил в Proteus, рабочая.