Ну как я понимаю у вас еще 2 обмотки по 6,3 вольта осталось не задействовано, это 4 вывода, если вы не знаете где начало и конец у каждой из этих двух обмоток, то соединяете например вторую клемму одной обмотки(6,3 В) и первую клемму второй обмотки (6,3 В), на оставшуюся пару контактов подключаете мультиметр (ставите его на переменное напряжение) и
КРАТКОВРЕМЕННО включаете трансформатор в сеть, если вольтметр покажет 12 Вольт. занчит вы все сделали правильно, и обмотки соединены последовательно. Если мультиметр покажет "0" значит вы обмотки включили встречно, быстро выключаете трансформатор и пробуете соединить по другому, например вторую клемму первой обмотки и вторую клемму второй обмотки, повторяете опыт.
Еще раз повторю что трансформатор нужно быстро включить и выключить, т.к. в случае ошибки при встречном включении обмоток они могут сгореть.