А проверьте показания мультиметром...
У меня - БП Чифтек APS-400S - месяцев 10
Действительно, если есть проблемы с конденсаторами БП на выходе, показания могут шалить и компьютер при первом включении может запускаться долго и потом резко выключаться.
Если есть возможность и если мультиметр будет показывать "чёрти что", разберите БП и исследуйте его визуально.
Новую материнку купили, случайно, не после выхода из строя старой ?!