Сначала внимательно всё прочитай: у тебя есть диск системный, есть загрузочный и есть активный раздел. Системный - диск, на котором лежит Windows, загрузочный - тот, на котором лежит ntldr и boot.ini для ХРюши или скрытый загрузочный раздел в семёрке. Активным может быть
один любой основной раздел на каждом физическом диске. Загрузочным является активный раздел на том диске, который указан в качестве загрузочного в биос или первый по порядку опроса активный раздел на любом физическом диске, если в биос разрешено искать загрузочные записи на всех последующих дисках. Путаница с буквами возникла потому, что ты начал устанавливать систему, не удалив предварительно и полностью все системные папки от старой установки.